La misión de PROCIANDINO en su contexto global, está orientada a contribuir al fortalecimiento de la capacidad y calidad tecnológica-cientitica agropecuaria en la subregión andina y respaldar el mejoramiento de la eficiencia y competitividad del proceso productivo, dentro de un contexto de sostenibilidad del medio ambiente y de los recursos naturales, en colaboración y bajo la coordinación de los Institutos Nacionales de Investigación Agropecuaria, la participación del sector privado, universidades y la cooperación técnica internacional