La misión de PROCIANDINO en su contexto global, está orientada a contribuir al fortalecimiento de la capacidad y calidad tecnológica-científica agropecuaria en la subregión andina y respaldar el mejoramiento de la eficiencia y competitividad del proceso productivo, dentro de un contexto de sostenibilidad de los recursos naturales y el medio ambiente, en colaboración y bajo la coordinación de los institutos nacionales de investigación agropecuaria, la participación del sector privado, universidades y la cooperación técnica internacional